Nemrud’daki çalışmalara başlanmadan önce, her seferinde, gerekli izinler alınmış, anlaşmalar yapılmıştır. Aşağıdaki protokollar elde edilmiştir:

1999 Protokolı
Protokol 24 Mart 1999 tarihinde yapılmış olup Kültür Bakanı İstemihan Talay tarafından imzalanmıştır. (bakınız Protocol 24 March 1999)

2001 Protokolı
Protokol 20 Temmuz 2001 tarihli olup 1999 protokolının yerine geçirilmiş ve Türk Hükümeti tarafından imzalanmıştır. Bu protokol ile Professor Herman Brijder’e Nemrud Dağı’ndaki arkeolojik araştırmaları yönetmesi izni verilmiştir. Professor Brijder ve Amsterdam Üniversitesi’nin bilgilerine göre bu protokol bugüne kadar hala geçerliğini korumaktadır. (bakınız Protocol 20 July 2001)

2006 Protokolı
Türk Kültür Bakanı Attila Koç ve Hollanda Kültür Bakanı Maria van der Hoeven, 14 Aralık 2006 tarihinde, Nemrud Müzesi’nin yapımı da dahil olmak üzere Nemrud Dağı projesi için 2.050.000 euroluk subsidi konusunda mutabakata vardılar. Protokol iptal edilmedi. (bakınız Protocol Letter of Intend 10 Oct 2006)